मैं आर स्टूडियो में velocyto.R के साथ अपने scRNA-seq डेटा का विश्लेषण करने की कोशिश कर रहा हूं। वेलोसाइटो ट्यूटोरियल के बाद, मैंने नीचे के रूप में velocyto.R स्थापित करने का प्रयास किया:

library(devtools)
install_github("velocyto-team/velocyto.R")

लेकिन, एक त्रुटि पॉप अप होती है:

ERROR: compilation failed for package 'velocyto.R'

removing 'C:/Users/USER/Documents/R/win-library/3.6/velocyto.R'
Error: Failed to install 'velocyto.R' from GitHub:
(converted from warning) installation of package ‘C:/Users/USER/AppData/Local/Temp/RtmpukpRFl/file37346a812b86/velocyto.R_0.6.tar.gz’ had non-zero exit status

क्या ऊपर वर्णित एक ही समस्या का सामना करने और इसे हल करने में सफल होने वाला कोई है? मुझे मदद की सख्त जरूरत है!

धन्यवाद

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Juhee Jeong 8 जून 2020, 09:26

1 उत्तर

सबसे बढ़िया उत्तर

जैसा कि आपका त्रुटि लॉग C:/... कहता है, आप शायद Windows का उपयोग करते हैं। वेलोसाइटो के README के अनुसार ऐसा लगता है कि यह पैकेज केवल यूनिक्स-फ्लेवर पर चलता है सिस्टम C++11, Open MP, boost, igraph और hdf5c++ लाइब्रेरी के साथ।

यह समस्या हो सकती है: वेलोसाइटो के GitHub मुद्दे को पढ़ें #40, शायद आपको इसे डब्लूएसएल के तहत चलाने की आवश्यकता होगी ...?

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user13653858user13653858 8 जून 2020, 10:39